Ważnym etapem w rozwoju umysłowym Zofii Izabeli Łuszczkiewicz były jej studia uniwersyteckie. Zgodnie z tradycją rodzinną odbyła je na Uniwersytecie Jagiellońskim. Studiowała tam w latach 1917/18-1921/22. W okresie tym kobiety miały już na krakowskiej uczelni dość ugruntowaną pozycję chociaż nie zostały całkowicie zrównane w prawach z mężczyznami. Pierwsze trzy studentki pojawiły się w Krakowie w r. 1894, na Wydział filozoficzny zostały formalnie dopuszczone w r. 1897 na lekarski w r. 1900 natomiast na prawo dopiero w r. 1900. Zofia Łuszczkiewicz studiowała na Wydziale Filozoficznym nauki chemiczne. Uczęszczała na wykłady i ćwiczenia wybitnych uczonych takich jak Karola Dziewońskiego profesora chemii organicznej, Tadeusza Estreichera kierownika katedry chemii nieorganicznej i analitycznej wybitnego erudyty i popularyzatora wiedzy ora Bohdana Szyszkowskiego specjalisty z zakresu termodynamiki. Poza zajęciami z wybranego kierunku studiów uzupełniała wiedzę w zakresie biologii na wykładach Władysława Szafera, fizyki u Władysława Natansona a także na prelekcjach z filozofii prowadzonych przez Witolda Rubczyńskiego i Władysława Heinricha. Uzyskała zaliczenia ze wszystkich obowiązujących przedmiotów otrzymując w dn. 4 X 1922 absolutorium. Na uczelni krakowskiej zdobyła rzetelną wiedzę a także uczestniczyła w działalności społecznej (Koło Chemików) i miała możliwość pogłębienia religijności w Sodalicji Mariańskiej.